Warning: include(/data/htdocs/hebergementweb/sites/imagemed.univ-rennes1.fr/fr/nav.html): failed to open stream: No such file or directory in /data/htdocs/hebergementweb/sites/imagemed.univ-rennes1.fr/template.php on line 144

Warning: include(): Failed opening '/data/htdocs/hebergementweb/sites/imagemed.univ-rennes1.fr/fr/nav.html' for inclusion (include_path='.:/usr/share/pear:/data/htdocs/hebergementweb/php-include') in /data/htdocs/hebergementweb/sites/imagemed.univ-rennes1.fr/template.php on line 144

Warning: include(/data/htdocs/hebergementweb/sites/imagemed.univ-rennes1.fr/fr/menuLat.php): failed to open stream: No such file or directory in /data/htdocs/hebergementweb/sites/imagemed.univ-rennes1.fr/template.php on line 155

Warning: include(): Failed opening '/data/htdocs/hebergementweb/sites/imagemed.univ-rennes1.fr/fr/menuLat.php' for inclusion (include_path='.:/usr/share/pear:/data/htdocs/hebergementweb/php-include') in /data/htdocs/hebergementweb/sites/imagemed.univ-rennes1.fr/template.php on line 155

Téléchargez MRQuantIF pour quantifier le fer et la graisse hépatique

MRQuantif (ex IronByMR) est un logiciel Java fonctionnant sur PC, Mac, Linux ...

Téléchargez le fichier ci-dessous qui contient le logiciel dans un répertoire "MRQuantif",
Décomprimez le contenu du fichier zip où vous voulez, a priori à la racine de votre disque principal mais cela peut être n'importe où y compris sur une clef USB
Lancez ensuite MRQuantif.exe ou MRQuantif.bat ou MRQuantif.jar en double-cliquant sur : ou sur : .
Si rien ne passe c'est qu'il y a une erreur, soit vous n'avez pas Java 8, suivez alors les consignes plus bas, soit tracez l'erreur en lançant le logiciel avec "MRQuantifShowTrace.bat".

L'intégration dans le PACS Telemis est automatisée. Pour les autres PACS allez voir la page Intégration au PACS.

Afin de mettre en place une assurance qualité compatible avec une utilisation médicale, vous devez maintenant être inscrit avec un email valide. Vous pourrez ainsi être alerté personnellement en cas de note de sécurité et diffuser cette information à tous les autres utilisateurs de votre structure. Vos coordonnées ne seront pas utilisées dans un autre but. Elle ne seront pas divulguées à un tiers. Votre mot de passe est crypté dans la base de façon non-réversible. Vous pouvez effacer vos données et annuler votre droit à licence en cliquant ici.

Pour accéder au téléchargement vous devez être inscrit avec un e-mail valide. Cliquez en haut à droite sur "Connexion" puis sélectionnez "Inscription".

Votre fichier de licence personnalisé est intégré dans chaque téléchargement, de la version complète ou d'un update.

La nouvelle version est disponible ci dessous. Si vous utilisez rarement ce logiciel vous pouvez aussi ne rien installer et tester la version on-line mais elle n'est pas encore complètement validée pour tous les navigateurs. Utilisez de préférence chrome ou sinon IE edge. Vérifiez que cela fonctionne avec vos données. Attention, le temps de processing est plus long (30 s) qu'avec la version java classique ou la version intranet (bientôt disponible).

Version complète (2024.11.30)

Mise à jour (2024.11.30)

(19.9 Mo)

Ce zip contient un répertoire MRQuantif que vous devez de préférence placer à la racine de votre disque principal (C:\).
Au premier lancement la configuration sera créée. Autorisez, si vous avez les privilèges requis, le logiciel accéder à internet pour faciliter les mises à jour.
La page de configuration vous permet, à tout moment, de paramétrer les deux fonctions séparément : la mise à jour et l'export anonymisé des résultats.

Si vous avez activé, dans la configuration de MRQuantif, l'option internet avec recherche des mises à jour c'est plus simple pour vous, la mise à jour sera proposée automatiquement dans le logiciel.

Autrement, pour mettre à jour manuellement une version antérieure à la version en ligne téléchargez ce fichier. Si besoin, renommez-le "MRQuantif_Update" ou "MRQuantif_Update.zip" si les extensions ne sont pas masquées et placez-le dans le répertoire MRQuantif. Au prochain lancement, le logiciel MRQuantif va détecter ce fichier et vous proposer de lancer la mise à jour.

Si cela ne réussit pas, copiez en bloc les fichers et répertoires contenus dans le fichier "MRQuantif_Update.zip" dane le répertoire MRQuantif et acceptez tous les remplacements.

En cas de difficulté de mise à jour, vous pouvez ré-installer complètement le logiciel mais avant vous pouvez conserver le répertoires "my_data" pour garder vos résutats précédents. Conservez aussi le répertoire "jre" si vous l'aviez téléchargé. Vous pourrez le(s) recopier ensuite dans la nouvelle installation.

Si après tout cela vous resté bloqué contactez moi par email (cf infra).

Cliquez ici pour télécharger votre licence. Placez-la ensuite dans le dossier principal de MRQuantif ou dans le répertoire "my_config". Si besoin changez le nom fichier en "license.bin".

Updated on November 30th, 2024

Historique des versions

Version 2024.11.30 

BUG FIXED AND CHANGES

From the recent version (two days ago):
- Correction of a bug selection after browsing in case of several studies
- Improvement of direct series selection
- Display of series list after browsing if only one study found.
- Better merging when there is a great number of subseries.
- Better control of PDFF error calculation when inaccurate TEs values
  
From older version:
- Better export configuration and correction of a report export bug when using the folder mode.
- Tests are now performed automatically when changing DICOM store settings (SCU or SCP). 
- More in-depth testing using sample DICOM images can also be performed in the "Logs" tab.
- More options to manually export the report in the "Report" tab
- More R2* to LIC conversion formulas that can now be applied to all magnetic fields. The "Gandon" option identically replaces the "standard" option. This conversion is an average between the d'Assignies (and Gandon) formula at 3T and the Garbowski formula at 1.5T. This formula also provides a value close to the SIR "Alustiza" method. 
- Introduction of the R2*/B0 index in the report which promotes a comparison of multi-site results.

Thank you for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if you encounter any problems with this version.

Prof. Yves Gandon
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Version 2024.11.28 

BUG FIXED AND CHANGES
- Better export configuration and correction of a report export bug when using the folder mode.
- Tests are now performed automatically when changing DICOM store settings (SCU or SCP). 
- More in-depth testing using sample DICOM images can also be performed in the "Logs" tab.
- More options to manually export the report in the "Report" tab
- More R2* to LIC conversion formulas that can now be applied to all magnetic fields. The "Gandon" option identically replaces the "standard" option. This conversion is an average between the d'Assignies (and Gandon) formula at 3T and the Garbowski formula at 1.5T. This formula also provides a value close to the SIR "Alustiza" method. 
- Introduction of the R2*/B0 index in the report which promotes a comparison of multi-site results.

Thank you for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if you encounter any problems with this version.

Prof. Yves Gandon
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Version 2024.10.01 

BUG FIXED AND CHANGES

- Images sent via DICOM store SCP protocol now remain in the import path in the standalone version. 
They are sent to my_data/studies in the server version.
- Sequence recognition is applied after DICOM reception.

- Report language saving bug fixed. To change permanently report language use the configuration panel.
- DICOM export to PACS: sending AET is now the defined SCP receiver AET.
- Intranet server version improvements. Now, by default, integrated H2 database is used instead of MySQL.


Thanks for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
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Version 2024.09.24 

BUG FIXED AND CHANGES

- Report language saving bug fixed. To change permanently report language use the configuration panel.
- DICOM export to PACS: sending AET is now the defined SCP receiver AET.
- Intranet server version improvements. Now, by default, integrated H2 database is used instead of MySQL.


Thanks for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2024.09.23 

BUG FIXED AND CHANGES

- DICOM export to PACS: sending AET is now the defined SCP receiver AET.
- Intranet server version improvements. Now, by default, integrated H2 database is used instead of MySQL.


Thanks for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2024.07.05 (six months validity because a major update will occur this autumn)

BUG FIXED AND CHANGES

- DICOM export to PACS +++ : Please note that automatic export to PACS is no longer available and has been replaced by a better manual export. To ensure that the sent report is viewed before exporting, you must now use the button in the left banner of the report page, or its keyboard equivalent 'ctrl-s'.

- Immediate language switching.


Thanks for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
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Version 2024.05.17 (six months validity because a major update will occur this summer)

BUG FIXED

- DICOM export to PACS corrected
- Better reading of DICOM MR Enhanced format use optionnaly by Siemens 


Thanks for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
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Version 2023.05.29 (> one year validity)

BUG FIXED

- DICOM Store SCP configuration is now correctly saved


IMPROVEMENTS

- DICOM Store SCP configuration: batch file (mrq_scp.bat) creation mode is now added 


Thanks for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2023.05.12 (> one year validity)

BUG FIXED

- better recognition of the shortest TE in case of merged series


IMPROVEMENTS

- Better recognition of DICOM MR Enhanced
- Compatible with intranet version (being tested in some institutions)


Thanks for any feedback.
 
Contact me by email (yves.gandon@yahoo.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2022.09.26 (> one year validity)

BUG FIXED

- from the 2022.09.16 version: Siemens coils not recognized and wrong error messages
- before :
	- No data and no report in some circonstances
	- No access to translation site

IMPROVEMENTS (from versions before the 2022.09.16 version)

- Now partial recognition of DICOM MR Enhanced
- Warning in case of wrong selection of coils in Siemens when spinal coils were used instaed of body coil


Thanks for the feed back.
 
Contact me by email (yves.gandon@univ-rennes1.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2022.09.16 (> one year validity)

BUG FIXED

- No data and no report in some circonstances
- No access to translation site

IMPROVEMENTS

- Now partial recognition of DICOM MR Enhanced
- Warning in case of wrong selection of coils in Siemens when spinal coils were used instaed of body coil


Thanks for the feed back.
 
Contact me by email (yves.gandon@univ-rennes1.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2022.05.20 (> one year validity)

BUG CORRECTIONS

Fixed:

Fixed in the version of May 05th:
- No data and no report when ROIs (particularly spleen) were disabled
- Inadequate Siemens coil error message
- Logs selection was not working. Now selection is working but there is also a send all button which selects the 100 last logs (can be filtered)

Fixed in this version of May 20th:
- Dysfunction when used through a share space

Sorry for the inconvenience.

Thanks for the quick feed back.
 
Contact me by email (yves.gandon@univ-rennes1.fr) if any trouble with this release.


Prof. Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2022.05.05 (> one year validity)

BUG CORRECTIONS

- No data and no report when ROIs (particularly spleen) were disabled
- Inadequate Siemens coil error message
- Logs selection was not working. Now selection is working but there is also a send all button which selects the 100 last logs (can be filtered)

Sorry for the inconvenience.

Thanks for the quick feed back.
 
Contact me by email (cf email on web site) if any trouble with this release.

Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2022.04.13 (> one year validity)

IMPROVEMENTS

- New log system not using Log4J anymmore
- Internet export data is now managed in protocols
- Server_ready version
- New license module 
 
Contact me by email (cf email on web site) if any trouble with this release.

Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2021.02.08 (> one year validity)

SMALL BUG CORRECTIONS AND FEW IMPROVEMENTS

This version have few small improvements such as an easier way to precise the coil used when the information has been removed by the de-identification process.
 
Contact me by email (cf email on web site) if any trouble with this release.

Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2020.11.11 (> one year validity)

BUGS FIXED / BUGS CORRIGES

This version corrects bugs of the recent (2020.10.26, 11.05 and 11.08) releases, and particularly from the last update:
- license error message due to not recognizing emails with capitals or multiple dots in the domain.
- delete downloaded files if the update download is interrupted


Improvement : update downloading can start even if license is not found or recognized.
 
Contact me by email (cf email on web site) if any trouble with this release.

Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2020.11.08 (> one year validity)

Important.

This version corrects bugs of the recent (2020.10.26 and 11.05) releases:

- malformed extended characters in the RTF report signature
- not recognition of emails with uppercases.

Improvement : you can now activate in configuration password control (define passwords un user list, by default passwords are empty).
 
Contact me by email (cf email on web site) if any trouble with this release.

Yves Gandon
---------------------------------------------------------------------------------------------
Version 2020.11.05 (> one year validity)

Important.

This version corrects bugs of the recent annual last week (2020.10.26) release:

- errors in FF calculation providing -1 value. Now this should occur only when there is too much iron to estimate FF.
- complex method is now allowed even if there is no exact out-phase TEs. The new control is more permissive.
- series merging: merging of series with the same date is now activated by default,a button for  manual merging appears when several series has been selected, memorization is possible 

Contact me by email (cf web site) if any trouble with this release.

Yves Gandon
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Version 2020.26.10 (one year validity)

This version has some new functions with improvement of merging, protocols, translation ...

A client-server version is now integrated (a short documentation will be on-line soon) but I am also preparing the download of a full intranet version for large institutions. 

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Version 2019.11.06

Bug correction:
- ROI resizing was not working in the new version. This has been fixed.
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Version 2019.11.05

Improvements:
. protocols allowing more customization can be managed by a protocols tab. A folder "protocols" can be copied between different computers.
. plugins will be progressively avalaible
. users are now more easily managed in a specific tab. The users.json file store all the user informations.
- localization is now better managed with specific properties files in the localisation folder. The user interface localisation is still in work in progress with partial translation and only two languages. Completion of the user interface translation, more languages and on-line collaborative mechanism will be avalaible in few weeks.

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Version 2019.05.12

Bug correction and improvements:

Only few changes to improve the registration process
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Version 2019.05.08

With this new version the recording should now work properly even if some functions are not completely finalized.
Do not worry, MRQuantif can run without registration until the end of June

If you encounter a blocking problem, contact me.

Y Gandon

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Version 2019.04.14

Inscription not ready, postponed to the beginning of May

Bug fixe since the previous version:
- user configuration error when launching a complete new install causing freezing ...


Bug fixe since the version before:
- wrong iron map recognition is corrected
- user data was not saved correctly
- italian reporting was improved

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Version 2019.04.14

Inscription not ready, postponed to the beginning of May

Bug fixe since the previous version:
- wrong iron map recognition is corrected
- user data was not saved correctly
- italian reporting was improved

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Version 2019.04.03

Bug fixe since the 04.02 version:
- correction of a bug of maps recognition when browsing

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Version sur clef USB (Windows)

Vous pouvez installer MRQuantif sur une clef USB et l'utiliser sans rien écrire sur l'ordinateur utilisé.
Installez le logiciel sur la clef et ajoutez, dans le répertoire MRQuantif, le répertoire "jre" téléchargeable dans un zip ci-dessous.
Lancez le logiciel, si besoin par un double-click sur "MRQuantifWithLocalJRE.bat" qui va forcer le lancement du logiciel avec le Java8 présent dans le répertoire "jre".

Dépannage

Il est très difficile d'éviter la survenue d'erreur lors d'une nouvelle version majeure car MRQuantif utilise des données locales qui peuvent être très variables. Les nouvelles versions qui suivent dans la foulée corrigent les erreurs pour arriver à une version rapidement stable.
Si le logiciel apparait tout petit c'est que vous avez un écran à haute densité de pixels. Il suffit de faire un clic droit sur le java que vous lancez et d'aller dans propriétés/compatibilité pour définir que la mise à l'échelle PPP doit se faire par l'application.
Si vous avez une version antérieure de Java, vous obtiendrez un message d'erreur lors du lancement du logiciel.
Lancez le logiciel par MRQuantifShowTrace.bat pour tracer les erreurs.
Si rien ne se passe, cela signifie que Java n'est pas installé sur votre ordinateur.

Que faire si Java 8 n'est pas installé ?

Si vous avez les droits pour l'installer sur votre ordinateur allez sur le site d'Oracle pour télécharger et installer Java 8 (ou encore appelé 1.8).
Sinon, sur PC Windows téléchargez ici et décompressez le dans le répertoire qui contient le logiciel MRQuantif. Vous devez ainsi avoir ajouté un répertoire jre qui contient un exécutable java 8. Lancez alors MRQuantif.bat en double-cliquant uniquement sur : .

Important ! Pour simplifier le processus d'import des images DICOM consultez la page Intégration au PACS.

Vous rencontrez une difficulté non résolue par les explications contactez-moi (yves.gandon@univ-rennes1.fr).

updated: April 14 2022 07:33